Een affiliatecookie is een klein bestand dat op de computer of het apparaat van een gebruiker wordt opgeslagen wanneer deze via een affiliate-link op een website klikt. Deze cookie bevat informatie over de affiliatepartner en registreert de klik, zodat het systeem kan volgen welke affiliate verantwoordelijk is voor het doorverwijzen van de gebruiker naar de adverteerder.
Wanneer de gebruiker binnen een bepaalde periode (de zogenaamde “cookie lifespan”) een aankoop doet of een andere gewenste actie uitvoert op de website van de adverteerder, wordt de commissie toegekend aan de affiliate. De levensduur van een affiliatecookie kan variëren van enkele uren tot 30 dagen of langer, afhankelijk van de voorwaarden van het affiliateprogramma. Dit systeem maakt het mogelijk voor affiliates om op correcte wijze beloond te worden voor hun promotiewerk, zelfs als de verkoop niet direct plaatsvindt na de eerste klik.